De beurs zei dat de handelsstop, die om 1000 CET (0800 GMT) begon, betrekking had op obligaties, derivaten, op de beurs verhandelde producten, aandelen en fondsen, en zei dat verdere informatie zal volgen.
De Zwitserse beurs is de thuisbasis van bedrijven zoals Nestlé, Roche en UBS.
"Marktgegevens en indexgegevens worden momenteel niet verspreid en we onderzoeken de oorzaak en proberen deze op te lossen," vertelde een woordvoerder van SIX aan Reuters.
"De handel werd niet beïnvloed, maar we moesten de handel in Zwitserland stilleggen vanwege de gelijke behandeling van marktdeelnemers."