10x Genomics, Inc. kondigde de eerste commerciële zendingen aan van zijn Xenium-platform voor in situ analyse. Xenium is de volgende generatie van gerichte ruimtelijke profilering van genen en eiwitten met subcellulaire resolutie. Het platform omvat een veelzijdig en gebruiksvriendelijk instrument, een gevarieerd menu van gecureerde, aanpasbare en hoogwaardige panels, en Xenium Explorer, intuïtieve software voor interactieve datavisualisatie.

Dankzij de toonaangevende snelheid en verwerkingscapaciteit maakt Xenium subcellulaire kartering van honderden RNA-targets mogelijk, waarbij gegevens van hoge kwaliteit met een hoge gevoeligheid en specificiteit worden gegenereerd om nieuwe inzichten in de structuur en functie van cellen te verkrijgen. Next-generation sequencing en imaging hebben dramatische gegevens opgeleverd en de resolutie van cellen in actie verfijnd, maar beide gebieden hebben zich afzonderlijk ontwikkeld. Dankzij de hoge cellulaire resolutie van het Xenium Platform kunnen onderzoekers de relatie tussen cellulaire structuur en functie beoordelen, direct in weefsel, zonder de noodzaak van sequencing, waardoor de werelden van genomica en pathologie worden overbrugd.

Enkele belangrijke kenmerken van het Xenium-platform zijn: Toonaangevende snelheid en verwerkingscapaciteit. Xenium heeft een zeer groot afbeeldbaar gebied en is het hoogste doorvoer In SiSitu-instrument in zijn klasse. Met Xenium, kunnen onderzoekers het meeste weefselgebied analyseren, met een enkele molecule resolutie, in de minste hoeveelheid tijd.

Breed menu van genpanelen. Het Xenium platform biedt een divers menu van gedefinieerde, gevalideerde, biologisch relevante inhoud met de mogelijkheid om grote aantallen aangepaste genen toe te voegen. Met de lancering van de Xenium Analyzer introduceert 10x Genomics twee gerichte panels, compatibel met een breed scala aan vers ingevroren en FFPE monsters, die kunnen worden aangepast voor specifieke onderzoeksvragen.

10x Genomics verwacht in 2023 aanvullende panels te introduceren, specifiek voor weefseltype en toepassing. Compatibiliteit met standaard pathologie, inclusief H&E. Xenium is ontworpen om de weefselmorfologie intact te laten. Dit maakt aanvullende inzichten van hetzelfde weefselsegment na afloop mogelijk, zodat onderzoekers kunnen kijken naar overeenkomsten tussen de moleculaire gegevens en de morfologische beelden.

Uitgebreide on-board analyse. Xenium biedt on-instrument primaire en secundaire gegevensanalyse, inclusief celsegmentatie, parallel aan de instrumentrun. Dit maakt directe verkenning van de gegevens mogelijk zonder verdere verwerking buiten het instrument, waardoor de tijd tot het resultaat wordt versneld en de computationele last voor klanten sterk wordt verminderd.

Xenium Explorer interactieve visualisatiesoftware. Vandaag lanceerde het bedrijf ook Xenium Explorer, zijn gebruiksvriendelijke desktopsoftware voor interactieve verkenning en gegevensanalyse. Xenium Explorer maakt gebruik van de exploratieklare uitvoer van het platform, zodat onderzoekers onmiddellijk resultaten kunnen zien op subcellulaire en weefselschaal.

Met Xenium hebben onderzoekers ook de flexibiliteit om standaardformaat eencellige en nieuwe open standaard ruimtelijke data-uitvoer te gebruiken met door de gemeenschap ontwikkelde analysetools.