Bionano Genomics, Inc. kondigt de publicatie aan van een studie die optische genoommapping (OGM) gebruikt om numerieke en structurele veranderingen in twee geïnduceerde pluripotente stamcellijnen (iPSC), WTC-11 en Tuba1-GFP, tijdens langdurige kweek te onderzoeken. Dit onderzoek biedt wetenschappelijke en praktische ondersteuning voor het gebruik van OGM workflows in de regeneratieve geneeskunde, omdat OGM honderden structurele varianten (SV's) kan opsporen, waarvan vele niet door andere cytogenetische methoden gezien waren en die de genomische integriteit van iPSC's kunnen beïnvloeden. iPSC's hebben het potentieel om patiënten een grotere klinische impact te geven dan stamcellen, terwijl ze mogelijke immunologische afstoting vermijden omdat ze afgeleid kunnen worden van de patiënt die behandeld wordt.

Om voor genbewerking te kunnen worden gebruikt, moeten iPSC's in cultuur worden gemaakt en geëxpandeerd, wat de mogelijkheid opent dat er in de loop van de tijd chromosomale varianten bijkomen. In de studie, gepubliceerd in Genes, volgden de auteurs twee cellijnen gedurende 150 dagen van ononderbroken kweek, of 50 passages, en vonden bij beide aanzienlijke veranderingen in het genoom met gebruikmaking van OGM. Bovendien werden in beide cellijnen honderden SV's waargenomen die niet in de interne controledatabank gevonden werden, en die zich in de loop van de studie ophoopten, en mogelijk van invloed waren op de genexpressie en de overleving van de cellen.

De auteurs suggereren ook dat, vanwege de accumulatie van chromosoomveranderingen in de loop van de tijd en de onbekende effecten op iPSCs in therapie, de kweekduur beperkt moet worden.