Kayishema zou de moord op ongeveer 2.000 Tutsi-vluchtelingen bij de katholieke kerk Nyange tijdens de genocide van 1994 in Rwanda hebben georkestreerd, aldus het Internationaal Overblijvend Mechanisme voor Strafrechtelijke Tribunalen (IRMCT).

Hij is sinds 2001 op vrije voeten.

"Fulgence Kayishema was meer dan twintig jaar voortvluchtig. Zijn arrestatie zorgt ervoor dat hij eindelijk berecht zal worden voor zijn vermeende misdaden," zei aanklager Serge Brammertz van het IRMCT.

Kayishema werd in 2001 aangeklaagd door het Internationaal Straftribunaal voor Rwanda van de V.N., dat hem beschuldigde van genocide en misdaden tegen de menselijkheid voor moorden en andere misdaden gepleegd in de prefectuur Kibuye.

Brammertz zei dat het onderzoek dat leidde tot zijn arrestatie meerdere landen in Afrika en daarbuiten omvatte, en mogelijk werd gemaakt door de steun en medewerking van de Zuid-Afrikaanse autoriteiten.

Het in Tanzania gevestigde Rwanda-tribunaal beëindigde zijn zaken in 2008, waarna het IRMCT werd opgericht om het resterende werk af te maken.

Het tribunaal verwees Kayishema's zaak naar Rwanda in 2007, nadat het land de doodstraf had afgeschaft.