De dieren verlieten de haven van Fremantle in Perth op 5 januari, maar halverwege naar het Midden-Oosten verliet het schip zijn route en kreeg het bevel van de Australische regering om naar huis te gaan.
De ommekeer maakte deel uit van de ravage die werd aangericht door de Houthi-aanvallen ter ondersteuning van Hamas-militanten in Palestina, die expediteurs hebben gedwongen om langere en duurdere reizen rond zuidelijk Afrika te maken.
Het vee verbleef wekenlang in het ongewisse aan boord van het schip en, sinds het half februari van boord ging, aan land, waar het volgens de Australische bioveiligheidswetten in quarantaine moest.
Activisten en sommige politici bestempelden de behandeling van de dieren als marteling en eisten een snel einde aan de handel in levende schapen, maar de regering en de industrie zeggen dat de dieren in goede conditie en gezondheid verkeren.
Het ministerie van Landbouw zei half februari dat er vier runderen en 64 schapen aan boord van de Bahijah waren gestorven sinds het schip op 5 januari was vertrokken, maar dat het sterftecijfer onder de meldingsgrens lag.
Het vee werd in het weekend op hetzelfde schip geladen als waarmee ze vertrokken, de MV Bahijah, en vertrok zondag uit Fremantle, zei Geoff Pearson, hoofd veeteelt bij landbouwgroep WAFarmers.
Hij zei dat er ongeveer 14.000 schapen en 500 runderen aan boord waren en dat het resterende vee in de komende weken met andere schepen geëxporteerd zou worden.
Het ministerie van Landbouw zei dat het de zending had goedgekeurd.
"De exporteur is van plan om het vee naar Israël te vervoeren zonder door de Rode Zee te varen," zei het in een verklaring.
De route van Australië rond Afrika naar Israël duurt ongeveer 33 dagen, zeggen cijfers uit de sector.
Reuters heeft geen contact kunnen opnemen met de exporteur, Bassem Dabbah. De manager van het schip, Korkyra Shipping, heeft niet gereageerd op verzoeken om commentaar. (Verslaggeving door Peter Hobson; Bewerking door Lincoln Feast.)
