Exscientia plc kondigde de uitbreiding aan van zijn platform met het ontwerp van biologische geneesmiddelen, zoals menselijke antilichamen. Het bedrijf heeft het hele jaar door AI-gestuurde mogelijkheden voor virtueel biologisch ontwerp ontwikkeld en richt nu in Oxford een geautomatiseerd biologisch laboratorium op om intern nieuwe antilichamen te genereren en te profileren. De huidige benaderingen om antilichamen te optimaliseren, zelfs die waarbij gebruik wordt gemaakt van machinaal leren, zijn nog steeds afhankelijk van het ontdekken van antilichamen door middel van experimentele screeningmethoden.
De combinatie van generatief AI-ontwerp en virtuele screening van biologische geneesmiddelen zou onderzoek van een bredere antilichaamruimte mogelijk maken en Exscientia's doel ondersteunen om al zijn biologische geneesmiddelen de novo te ontwerpen voor specifieke doel-epitopen zonder dat screening nodig is. Om nieuwe antilichamen tegen specifieke eiwit-epitopen te ontwerpen, is het noodzakelijk om snel en op schaal nauwkeurige modellen van hun structuur te genereren. De eerste versies van de technologie, uitgevonden door professor Charlotte Deane, Exscientia's Chief Scientist of Biologics AI, produceerden nauwkeurige eiwitmodellering tot 35.000 keer sneller dan Alphafold2 (Abanades et al.Bioinformatics 2021).
Exscientia heeft de reikwijdte, snelheid en integratie van deze algoritmen aanzienlijk uitgebreid en tegelijkertijd de mogelijkheden geïntegreerd in zijn bredere platform. Exscientia's virtuele screeningmethode voor antilichamen is nu meer dan drie keer nauwkeuriger dan de gepubliceerde stand van de techniek. De sleutel tot Exscientia's AI-aanpak is het gebruik van de kennis van de waargenomen menselijke antilichaamruimte om biologische geneesmiddelen voor klinische ontwikkeling te optimaliseren.
De bindingsplaats van het antilichaam bestaat uit twee ketens (zware en lichte). Gewoonlijk is de sequentiebepaling van antilichamen beperkt tot enkele ketens, waardoor de ware biologie van antilichamen verloren gaat. Het bedrijf bouwt aan een eigen database van gepaarde ketensequenties om de complexe biologie van antilichamen in een meer natuurlijke omgeving beter te begrijpen.
Exscientia gebruikt deze gegevens voor machine learning om de menselijke antilichaamruimte nauwkeuriger te beschrijven en te modelleren. Exscientia's nieuwe laboratoriumfaciliteiten, die een extra 8.000 vierkante meter toevoegen aan het hoofdkantoor in het Oxford Science Park, zullen de productie van eigen gegevens voor elk antilichaam automatiseren, waarbij essentiële kwaliteiten zoals affiniteit, immunogeniciteit, aggregatie en stabiliteit worden gemeten. De ingenieurs van Exscientia bouwen eigen automatiseringshardware voor high-throughput antilichaamprofilering ter ondersteuning van de ontwikkeling van voorspellende modellen voor multi-parameter optimalisatie.