Het Israëlische leger zei dat de vrouw naar soldaten bij een controlepost was gerend en geen acht had geslagen op oproepen of waarschuwingsschoten om te stoppen.
Het leger zei dat er geen wapen op haar was gevonden en dat het incident werd onderzocht.
Ambtenaren zeiden dat soldaten diezelfde dag ook een tweede Palestijnse vrouw doodden nadat zij een soldaat had neergestoken.
In de Israëlische stad Kfar Saba hebben rouwenden zondag de 27-jarige Eytam Magini begraven, die vorige week door een Palestijnse schutter werd gedood.
De Israëlische strijdkrachten zijn in hoge staat van alarm na aanslagen die sinds eind maart 14 mensen in Israël het leven hebben gekost.
Meer dan 20 Palestijnen, waaronder veel gewapende militanten, zijn sinds januari door Israëlische troepen gedood, terwijl Palestijnen melding hebben gemaakt van een toename van geweld door Israëlische kolonisten op de Westelijke Jordaanoever.
In openbare opmerkingen aan zijn kabinet op zondag zei de Israëlische premier Naftali Bennett dat de veiligheidstroepen agressief de strijd aanbinden met wat hij beschreef als een "nieuwe golf van terrorisme."
"Wij zullen gaan waar nodig, op elk moment, om deze terreurdaden de pas af te snijden. De staat Israël is in het offensief gegaan."
De Israëlische verdedigingstroepen hebben zondag beelden vrijgegeven van nachtelijke invallen op de Westelijke Jordaanoever, waarop te zien is hoe zij huizen doorzoeken en geblinddoekte mannen in hechtenis nemen.
Het Palestijnse Ministerie van Volksgezondheid zei dat een Israëlische inval in de stad Jenin op de Westelijke Jordaanoever 13 gewonden en één dode opleverde.
De Palestijnse Islamitische Jihad beweerde dat de gedode man een lid van de militante groep was.
De inval was gericht op het huis van een Palestijnse schutter die Magini en twee anderen doodde in een bar in een drukke straat in Tel Aviv, voordat hij vorige week door veiligheidstroepen werd doodgeschoten.
