De vogelgriep werd vorige week voor het eerst vastgesteld in een van de drie hallen van de boerderij, die 150 km ten westen van Praag ligt, en de autoriteiten waren dinsdag begonnen met de voorbereidingen om tot 220.000 vogels te ruimen.
Maar de veterinaire dienst van de Tsjechische Republiek (SVS) zei op woensdag dat een verdere verspreiding op het bedrijf had geleid tot het besluit om alle vogels daar te ruimen.
"Ondanks de genomen maatregelen en andere inspanningen was het niet mogelijk de verspreiding van de zeer besmettelijke pluimveeziekte naar verdere hallen te voorkomen en zal het hele bedrijf moeten worden geruimd", aldus de SVS.
Het virus kan worden overgedragen op mensen door contact met pluimvee, maar deskundigen zeggen dat het gezondheidsrisico voor mensen laag is.
De Tsjechische autoriteiten hebben pluimveebedrijven sinds november verplicht hun kuddes binnen te houden, maar de afgelopen weken is het aantal gevallen weer toegenomen.
De vogelgriep zet de toch al hoge voedselprijzen onder druk en leidt tot handelsbeperkingen in landen die pluimvee importeren.
Een recordaantal kippen, kalkoenen en andere vogels is gestorven bij uitbraken in de Verenigde Staten en Europa, en het virus verspreidt zich in Zuid-Amerika, Afrika en Azië.
