NanoString Technologies, Inc. kondigt de vrijgave aan van de eerste publieke dataset van het gehele transcriptoom verkregen met echte single-cell resolutie op de CosMx? Spatial Molecular Imager (SMI). De gegevens zullen worden toegelicht op de 42e jaarlijkse J.P. Morgan Healthcare Conference 2024 in San Francisco tijdens de bedrijfspresentatie van NanoString op 10 januari 2024 om 17.15 uur ET.

CosMx Whole Transcriptome Panel Bereikt Wetenschappelijke Moonshot: NanoString is het eerste bedrijf dat de wetenschappelijke doorbraak bereikt van het leveren van echte single-cell whole transcriptome imaging. Deze technologische mijlpaal werd bereikt met behulp van het CosMx SMI-platform, waarmee onderzoekers tegelijkertijd de expressie van elk eiwitcoderend gen in het menselijk genoom in situ kunnen visualiseren, wat de ultieme mogelijkheid biedt voor ruimtelijke biologie van één enkele cel. Het CosMx Whole Transcriptome Panel transformeert de mogelijkheid om biologische inzichten te halen uit met formaline gefixeerde paraffine-embedded (FFPE) weefselmonsters.

Door de expressie van bijna 19.000 genen tegelijk in beeld te brengen, biedt dit product bijna 40 keer zoveel dekking als assays die momenteel door concurrerende platforms op de markt worden gebracht. Onderzoekers kunnen nu miljoenen cellen per experiment onderzoeken, zeldzame celtypes identificeren en cel-tot-cel interacties in ruimtelijke context begrijpen, waardoor een uitgebreid begrip van cellulaire landschappen ontstaat dat nooit eerder toegankelijk was. Deze mogelijkheden zullen beschikbaar zijn tegen lagere kosten per enkele cel, terwijl er een hogere cellulaire doorvoer is dan bij traditionele single cell RNA sequencing (scRNA-seq). NanoString is van plan om het CosMx Whole Transcriptome Panel in 2025 commercieel te lanceren.

NanoString markeert deze mijlpaal met de openbare publicatie van een CosMx SMI-dataset met het hele transcriptoom, gegenereerd uit FFPE-monsters van gezond menselijk pancreasweefsel. Deze unieke dataset toont de functionele biologie van de alvleesklier en onthult zeldzame celtypes die normaal gesproken verloren gaan met traditionele scRNA-seq methoden. Deze dataset werd gegenereerd met behulp van een prototypeversie van het panel en de bijbehorende software, en de prestaties van de nieuwe mogelijkheid zullen naar verwachting verbeteren in de volledige commerciële versie, zodat deze na verloop van tijd nog indrukwekkender wordt.

NanoString verwacht grote belangstelling van de wetenschappelijke gemeenschap en zal de Whole Transcriptome mogelijkheden van CosMx SMI laten zien tijdens presentaties op de komende AGBT bijeenkomst in Orlando, Florida, 5-8 februari 2024. Klanten die toegang hebben gekregen tot prototypes van het CosMx Whole Transcriptome Panel zullen datasets presenteren die gegenereerd zijn op alvleesklierkanker, colorectale kanker en menselijke hersenen.

NanoString blijft ook op schema om te beginnen met de commerciële levering van het CosMx Human 6K Discovery Panel vanaf het eerste kwartaal van 2024. Dit innovatieve panel, dat 6x hogere plex biedt dan de huidige CosMx SMI-panelen, zal onderzoekers in staat stellen om dieper in celtoestanden en -functies te duiken, ingewikkelde cel-tot-cel-interacties te onderzoeken en nieuwe inzichten te leveren in ruimtelijke cellulaire reacties op een ongekend niveau.