Het leger zei dat Dr. Muhammad Abu Salamiyah de leiding had gehad over het uitgestrekte complex toen militanten van Hamas een netwerk van militaire infrastructuur opbouwden en wapens opsloegen in het ziekenhuis en op het terrein.
"In het ziekenhuis, onder zijn leiding, waren er uitgebreide terroristische activiteiten van Hamas," zei het in een verklaring.
Het Shifa Ziekenhuis, de grootste medische faciliteit in de Palestijnse gebieden, is aan beide kanten het middelpunt geweest van beschuldigingen van oorlogsmisdaden.
Terwijl Israël zegt dat Hamas zijn operationele structuren op de locatie heeft gevestigd, wat in strijd is met het internationaal recht, hebben de Palestijnen Israël beschuldigd van het aanvallen van een medische faciliteit waar duizenden burgers beschutting zochten tegen luchtaanvallen die duizenden mensen het leven hebben gekost.
Israëlische troepen drongen eerder deze maand het complex binnen en legden naar eigen zeggen minstens één goed uitgeruste tunnel bloot, evenals een hoeveelheid wapens die volgens hen aantoonden hoe het ziekenhuis door Hamas werd gebruikt.
Hamas en de artsen in het ziekenhuis hebben eerder beschuldigingen ontkend dat het complex voor militaire doeleinden werd gebruikt en het bewijsmateriaal dat door Israëlische functionarissen werd gepresenteerd, verworpen.
Het Palestijnse ministerie van Volksgezondheid zei dat Abu Salamiyah en een aantal artsen bij zonsopgang werden gearresteerd bij een controlepost op de weg die het noorden van Gaza met het zuiden verbindt, waar Israël Palestijnen uit het noorden heeft gezegd dat ze zich voor hun eigen veiligheid moeten verplaatsen omdat de militaire operatie doorgaat.
Het leger ondervroeg hem nog steeds, vertelde legerwoordvoerder luitenant-kolonel Richard Hecht aan verslaggevers op donderdagmiddag. Hij zei dat Abu Salamiyah niet in staat van beschuldiging was gesteld en dat niemand suggereerde dat hij lid was van Hamas.
"We namen hem mee om hem een paar vragen te stellen over waarom er onder zijn ziekenhuis zoveel terroristische activiteiten bovengronds en ondergronds waren," zei Hecht.
De Palestijnse minister van Volksgezondheid Mai Al-Kayla zei dat de arrestaties aantoonden dat Israël het internationaal humanitair recht aan zijn laars lapte. Ze zei dat de Palestijnse autoriteiten een beroep hadden gedaan op de Verenigde Naties en op organisaties zoals het Rode Kruis, om druk uit te oefenen op Israël om zijn koers te wijzigen.
Hamas gaf ook een verklaring uit waarin het de arrestatie van de artsen veroordeelde, die naar eigen zeggen in het ziekenhuis waren gebleven om de evacuatie van patiënten en gewonden te vergemakkelijken.
"We roepen het Rode Kruis en internationale organisaties op om zich in te zetten voor hun onmiddellijke vrijlating," aldus de organisatie.
