De strijders, die opgeëist worden als leden van de Fatah Al-Aqsa Martelaren Brigade, kwamen om bij een botsing voor zonsopgang bij een huis in Nabloes.
Het Palestijnse Ministerie van Volksgezondheid zei dat zes anderen gewond waren.
De politie zei dat Israëlische veiligheidstroepen bij een klaarblijkelijke arrestatie van een gezochte verdachte onder vuur kwamen te liggen.
Zij, citaat, "reageerden met levend vuur en andere middelen tot het neutraliseren van de terroristen in het huis en op het dak ervan".
Op Twitter veroordeelde Hussein al-Sheikh, een hooggeplaatste Palestijnse ambtenaar, wat hij omschreef als een misdaad begaan door "bezettingstroepen".
Israëlische troepen hebben de laatste maanden de invallen op de Westelijke Jordaanoever opgevoerd nadat mannen uit het gebied dodelijke straataanvallen hadden uitgevoerd in Israël.
De door de V.S. bemiddelde vredesbesprekingen, gericht op de oprichting van een Palestijnse staat in Oost-Jeruzalem, de Westelijke Jordaanoever en Gaza, zijn in 2014 ineengestort en hebben geen tekenen van heropleving vertoond.
Los daarvan heeft de Israëlische marine zondag geschoten op vissersboot die beschuldigd werd van het binnensmokkelen van Hamas-voorraden uit Egypte, nadat de twee bemanningsleden ontsnapt waren.
Een militaire woordvoerder zei dat het vaartuig was afgedwaald van Israëls zeekordon op Gaza, dat door Hamas wordt geregeerd.
De marine vuurde op de boot nadat deze geen gehoor gaf aan bevelen om te stoppen, zei het leger, eraan toevoegend dat het niet nader gespecificeerde voorraden voor Hamas vervoerde.
De voorzitter van de Palestijnse vissersbond zei dat dergelijke beschuldigingen in het verleden ongegrond zijn gebleken.
De vakbond zei dat de twee bemanningsleden in het water waren gesprongen en naar de kust waren gezwommen voordat de boot werd vernietigd.
