Minister van Buitenlandse Zaken Mayiik Ayii is een nauwe bondgenoot van Kiir en was eerder minister van het kabinet van de president.
Het was niet meteen duidelijk of de opzegging van Ayii verband hield met die van defensie en binnenlandse zaken, die een fragiel vredesakkoord met oppositieleider eerste vicepresident Riek Machar dreigen te vernietigen.
"Het is een normale zaak. Mensen kunnen worden afgelost en vervangen," zei Kiirs woordvoerder Lily Martin Manyiel.
Kiir en de troepen van Machar ondertekenden in 2018 een vredesakkoord dat een einde maakte aan vijf jaar burgeroorlog die 400.000 mensen het leven kostte en de grootste vluchtelingencrisis in Afrika veroorzaakte sinds de genocide in Rwanda in 1994.
De uitvoering van het akkoord, dat bekend staat als het gerevitaliseerde vredesakkoord voor Zuid-Sudan, verliep traag en de strijdende partijen botsten vaak over meningsverschillen over de verdeling van de macht.
Kiir en Machar zouden donderdag bijeenkomen om te proberen hun meningsverschillen op te lossen, na het ontslag van minister van Defensie Angelina Teny, die ook de vrouw van Machar is.
Kiir droeg het ministerie van Defensie over aan zijn partij, een rol die volgens de overeenkomst door Machars partij zou moeten worden benoemd.
Machar veroordeelde de stap en riep Kiir op om Teny weer aan te stellen, maar dreigde niet om van het vredesakkoord af te stappen.
