NetraMark Holdings Inc. kondigt de presentatie aan van nieuwe gegevens die aantonen dat de eigen NetraAI klinische onderzoeksoplossing het ingewikkelde web van factoren die bijdragen aan PD kan ontwarren en inzichten kan bieden die van toepassing zijn op andere neurodegeneratieve aandoeningen, waaronder AD. Door NetraAI toe te passen op een dataset van 588 personen die door de Michael J. Fox Foundation ter beschikking waren gesteld, werden meerdere markers geïdentificeerd die in verband worden gebracht met de pathogenese van PD, waaronder verschillende die nauw verbonden zijn met het immuunsysteem en immuunreacties. De gegevens werden gepresenteerd op een poster tijdens AD/PD?

2024, die 5-9 maart plaatsvond in Lissabon, Portugal. De poster, getiteld "Using NetraAI to Discover Parkinson's Disease Subtypes: Generative AI Reveals Transcriptomic Personas Linking Mitochondrial, Microbiome, and Immune Signaling," rapporteert de resultaten van een analyse waarbij NetraAI werd gebruikt om genetische factoren binnen specifieke subpopulaties van PD-patiënten te identificeren en centrale ziektewegen bloot te leggen. Een transcriptomische dataset van 397 patiënten met PD en 191 controles werd geanalyseerd met behulp van NetraMarks AttractorAI algoritmen om variabelen (hypotheses genoemd) te identificeren die specifieke subpopulaties binnen de dataset verklaren.

Transcriptomische gegevens bestaan uit RNA-transcripten en geven weer welke genen tot expressie komen in elke subpopulatie. Elk Netra-Perspectief binnen deze analyse verdeelt de patiëntenpopulatie in verklaarbare en onverklaarbare subgroepen van patiënten volgens een set variabelen en is ontworpen om verschillende aspecten van complexe ziekten zoals PD vast te leggen. Het combineren van verschillende NetraPerspectieven geeft een holistisch beeld van de patiëntenpopulatie, en integratie van de verschillende hypotheses onthult significante variabelen en trajecten die verband houden met PD.

De belangrijkste bevindingen van deze analyse zijn Eén Netra-Perspectief identificeerde twee onverklaarbare en drie verklaarbare subpopulaties aan de hand van gedefinieerde criteria en de statistische significantie van de variabelen. Binnen de verklaarbare subpopulaties identificeerde NetraAI een verhoogd aantal RNA-transcripten voor GPATCH2L (dat betrokken is bij het metabolisme van macromoleculen), Rbbp (dat transcriptie reguleert) en EphA1 (dat de ontstekingsreacties en neuropathologische veranderingen in een PD-model verbetert). Evaluatie van deze genen in een eiwit-eiwit interactienetwerk identificeerde verder verbanden met twee eiwitten die nauw verbonden zijn met immuungemedieerde functies: CLECB1 (dat cytotoxiciteit en cytokinesecretie reguleert), en IRAK3 (een negatieve regulerende marker van ontsteking).

In een ander Netra-Perspectief was het gen BPI (geüpreguleerd in PD), dat betrokken is bij de bescherming tegen gramnegatieve bacteriën, sterk betrokken. Deze variabelen worden voornamelijk geassocieerd met immuunsignalering, met name de reactie van het aangeboren immuunsysteem op microbiële pathogenen, waarbij interacties met het microbioom een rol kunnen spelen. Andere Netra-Perspectives identificeerden meer een mitochondriale en microbiome rol.

Deze bevindingen leiden tot de hypothese dat BPI bij sommige PD-patiënten tot overexpressie komt als beschermende immuunrespons op afwijkingen in het darmmicrobioom die van invloed zijn op de gezondheid van de hersenen.