Codex DNA, Inc. Toont potentieel van SOLA enzymatische DNA-synthesebenadering om ontwikkeling van vaccins en therapeutica te versnellen
18 januari 2022 om 14:03 uur
Delen
Codex DNA, Inc. heeft aangekondigd dat zijn R&D-team de gepatenteerde SOLA-technologie (Short Oligo Ligation Assembly) voor enzymatische DNA-synthese (EDS) heeft gebruikt om met succes de hemagglutinine- (H1) en neuraminidase- (N1) genen uit het genoom van het influenza A-virus te construeren. SOLA EDS is een duurzame, schaalbare en kosteneffectieve benadering die is ontworpen om de tijdsduur voor de constructie van synthetisch DNA, RNA en eiwitten aanzienlijk te verkorten in vergelijking met traditionele chemische synthese, waardoor de weg wordt vrijgemaakt voor een efficiëntere en effectievere ontwikkeling van op mRNA gebaseerde vaccins, diagnostica, therapeutica en geneesmiddelen. SOLA EDS-technologie zal worden geïntegreerd in Codex DNA's toekomstige BioXp Oligo Printer en BioXp Digital-to-Biological Converter systemen, waardoor klanten kunnen beschikken over een end-to-end oplossing voor hun behoeften op het gebied van biowetenschappelijk onderzoek en synthetische biologie. De constructie van de H1- en N1-genen, die respectievelijk ongeveer 1.800 basisparen (bp) en 1.500 bp lang zijn, is de laatste belangrijke mijlpaal in de ontwikkeling van de SOLA EDS-technologie. Dit project heeft aangetoond dat Codex DNA in staat is op betrouwbare en reproduceerbare wijze korte DNA-oligo's met een lengte tot 100 bp te printen voor assemblage tot high-fidelity langere genen. In tegenstelling tot alternatieve EDS-technologieën die gebruik maken van terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT), waarbij één DNA-letter tegelijk wordt geassembleerd, genereert het gestroomlijnde SOLA DNA-proces lang synthetisch DNA van hoge kwaliteit uit een universele, vooraf vervaardigde bibliotheek van korte DNA-oligo's. De korte DNA-oligo's leveren de bouwstenen voor de efficiënte assemblage van complexe synthetische genen en mRNA-sjablonen met behulp van Codex DNA's industriestandaard Gibson Assembly®-methode op de geautomatiseerde BioXp-instrumentatie. De unieke aanpak van SOLA EDS pakt veel van de uitdagingen aan waarmee op TdT gebaseerde enzymatische DNA-synthesemethoden worden geconfronteerd met betrekking tot kosten, getrouwheid, produceerbaarheid, flexibiliteit en schaalbaarheid. Omdat SOLA gezuiverde en sequentiegecontroleerde DNA-bouwstenen combineert om oligo's te synthetiseren, heeft het de potentie om sneller, nauwkeuriger en met een hogere doorvoer te zijn dan bestaande EDS-technologieën. Bovendien kunnen deze DNA-bouwstenen in grote hoeveelheden worden vervaardigd en uitgebreid worden gebruikt voordat ze worden aangevuld, waardoor de kosten van DNA-synthese exponentieel worden verlaagd. Eenmaal geïntegreerd in de BioXp-instrumentatie zouden deze voordelen verschillende downstream-toepassingen mogelijk moeten maken, waaronder de ontwikkeling van vaccins, de ontwikkeling van therapeutica, diagnostiek, precisiegeneeskunde en de opslag van DNA-gegevens. Naast efficiëntievoordelen voor klanten zou SOLA EDS ook een positieve invloed op het milieu kunnen hebben. Traditionele processen voor de productie van oligo's brengen het gebruik van toxische chemicaliën met zich mee en produceren gevaarlijk afval. De SOLA EDS-technologie vermindert het gebruik van toxische chemicaliën drastisch. Codex DNA is van plan de kerntechnologie SOLA EDS vanaf 2023 in zijn geautomatiseerde familie van BioXp-systemen op te nemen, zodat de klanten kunnen beschikken over een complete benchtop-ervaring met druk op de knop.
Delen
Naar het originele artikel.
Wettelijke waarschuwing
Telesis Bio Inc. is een leverancier van oplossingen voor ribonucleïnezuur (RNA) en desoxyribonucleïnezuur (DNA). Het bedrijf levert geautomatiseerde multi-omische en synthetische biologische oplossingen die gericht zijn op het leveren van toepassingen waarmee onderzoekers snel en reproduceerbaar synthetisch DNA en boodschapper-Ribonucleïnezuur (mRNA) en korte oligonucleotiden van hoge kwaliteit kunnen maken of schrijven, die klaar zijn voor gebruik in vele downstream synthetische biologische markten. Het BioXp-systeem consolideert, automatiseert en optimaliseert de volledige synthese-, klonerings- en amplificatieworkflow. De op de markt zijnde en geplande oplossingen omvatten BioXp 3250 systeem, BioXp 9600 systeem, BioXp portal, BioXp De Novo kits, BioXp Select kits, BioXp Next Generation Sequencing kits, Benchtop reagentia en Custom Gibson Short Oligo Ligation Assembly (SOLA) enzymatische DNA synthese (EDS) oplossingen. BioXp Select kits bieden klanten de mogelijkheid om niet-Telesis Bio DNA te gebruiken terwijl ze het BioXp systeem gebruiken om synthetische biologie workflowtoepassingen uit te voeren.