Zij zijn boos over de ergste economische crisis van het land in zeven decennia.
Beelden van de plaatselijke media News Cutter toonden demonstranten binnen in het pand, dat in de commerciële hoofdstad Colombo ligt.
Het gezang dat te horen is, roept op tot het aftreden van president Gotabaya Rajapaksa.
Hij was niet in de residentie, zeiden twee bronnen van het Ministerie van Defensie, omdat hij op vrijdag (8 juli) vertrokken was in de aanloop naar de geplande betogingen in het weekend.
Op beelden die op de sociale media circuleerden, was te zien hoe sommigen baden in het zwembad in het huis van de president.
TV-beelden toonden ook duizenden die de poorten openbraken van het presidentieel secretariaat en het ministerie van Financiën, waar al maandenlang een sit-in wordt gehouden.
Te midden van de politieke crisis heeft het bureau van premier Ranil Wickremesinghe zaterdag gezegd dat hij bereid is af te treden om plaats te maken voor een regering van alle partijen.
Het eiland in de Indische Oceaan, met 22 miljoen inwoners, kampt met een ernstig tekort aan deviezen.
Essentiële invoer van brandstof, voedsel en medicijnen is beperkt.
Verwacht wordt dat de stijgende inflatie in de komende maanden 70% zal bereiken, waardoor de ontberingen van de bevolking nog groter zullen worden.
De situatie komt nadat de wereldwijde gezondheidscrisis de van het toerisme afhankelijke economie heeft getroffen en is nog verergerd door factoren als de enorme staatsschuld en de stijgende olieprijzen.
Maar velen wijten de neergang van het land aan economisch wanbeheer door Rajapaksa en grotendeels vreedzame protesten sinds maart hebben zijn aftreden geëist.
