Oxford Nanopore Technologies heeft de introductie aangekondigd van haar PromethION 2 (“P2”) Solo sequencer, 's werelds meest toegankelijke, high-yield sequencing apparaat met het potentieel om de toegang tot nauwkeurige, snelle en betaalbare sequencing voor menselijke genetica en andere grotere datasets sterk uit te breiden. Met een startpakket van 10.455 dollar is het P2 Solo apparaat de enige kleine sequencer met hoog rendement op de markt – in omvang gelijk aan één gedrukt deel van de Lord of the Rings trilogie. Hiermee kan iedereen verder gaan dan eenvoudige DNA-analyse door uitgebreidere analyse van genetische varianten, transcriptomische en epigenetische analyses op één enkel platform, om wetenschappelijke ontdekkingen te stimuleren en levens te verbeteren.

Voortbouwend op de bewezen waarde van het PromethION-platform, maakt het apparaat gebruik van zeer nauwkeurige nanopore-sequencing van native reads van willekeurige lengte (van 20 basen tot meer dan 4 miljoen basen) en legt het de volledige biologie vast, inclusief SNP's, INDEL's, structurele varianten en methylering vanuit één enkele flowcel. Dit is ontworpen om de genomicamarkt te openen door iedereen en overal te voorzien van hoogwaardige genoomsequencinggegevens in real-time: Het nieuwe P2 Solo apparaat geeft gebruikers de mogelijkheid om nanopore sequencing technologie te gebruiken om maar liefst 190-380 menselijke genomen per jaar uitgebreid te sequencen in hun eigen laboratoria. Met de PromethION 48 (“P48”) kunnen gebruikers opschalen tot 4.600-9.200 menselijke genomen per jaar.

Genoemde aantallen zijn 1-2 genomen per flowcel. Met het unieke “box is free” model dat Oxford Nanopore aanbiedt, kunnen gebruikers in hun eigen lab uitgebreide humane genomen voltooien voor minder dan $1.000 met de P2, of, wanneer ze in productiemodus werken met P48 toestellen, genoomprijzen bereiken van ongeveer $300 tot $600 (bij 1-2 humane genomen per flowcel, eenvoudige library prep kosten vanaf $43 per genoom, zonder extra kosten voor toestel, methylering en fragmenten van willekeurige lengte) met een toekomstig traject voor verdere verlagingen. De omvang en functionaliteit van de P2 Solo worden geëvenaard door zijn uitzonderlijke nauwkeurigheid, waarbij de nieuwste R10.4.1 flowcellen worden gecombineerd met de nieuwste Kit 14 om sequentiegegevens te leveren die modale raw-read simplex nauwkeurigheden van 99,6% (Q24) en single molecule duplex nauwkeurigheden van 99,92% (Q31) bereiken, met instelbare runvoorwaarden voor verdere flexibiliteit en optimalisatie.

In een vroeg programma onder een kleine test ‘ontwikkelaarsgroep is de P2 Solo al gebruikt voor het analyseren van kankeronderzoeksmonsters. Nanopore sequencing combineert de mogelijkheid om lange sequencing reads te genereren (tot 4 Mb) die complexe genomische regio's kunnen bestrijken, met geïntegreerde detectie van base modificaties (inclusief DNA/RNA methylering) en real-time resultaten. Dit biedt een complete, gestroomlijnde en snelle oplossing voor een uitgebreide karakterisering van kankermonsters.

De release van P2 Solo gaat gepaard met een whole genome workflow in EPI2ME, Oxford Nanopore's data analyse oplossing, waardoor gebruikers eenvoudig hun bestanden kunnen uploaden en met een simpele klik kleine varianten, structurele varianten en methyleringsrapporten terugkrijgen. De PromethION 2, Oxford Nanopore's volledig plug and play benchtopore nanopore sequencer in dezelfde range als de P2 Solo, bevat een krachtige GPU en draait op twee high-yield PromethION Flow Cells. Deze is beschikbaar voor pre-order en zal in de komende maanden worden verzonden.

De PromethION-serie is ontworpen om negatieve milieueffecten te minimaliseren door duurzaamheid verder te integreren in productontwerp, productieprocessen en dagelijkse werkzaamheden.